药学专业不仅是安庆医药高等专科学校重点建设的特色系部，也是安徽省特色专业建设点，安徽省示范实习实训中心，校企合作实践教育基地，获得中央财政支持的专业建设项目。同时也是安徽省药学技术人员继续教育基地之一。药学系是由其前身、创办于1945年的药剂专业发展而来，是我校开设最早的专业之一，开创全省药学教育之先河。在六十九年的教学实践中，学校始终重视技能型、实用型人才的培养，为社会输送了大批优秀的药学专业人才。
核心课程：实用药物学基础(药理学 药物化学)、临床药物治疗学基础、药事管理与法规、药剂学药物检测分析技术、药学综合知识与技能等。
实习实训：在校内进行药品生产、质量检验、药品调剂、用药指导等实训。在医院药剂科、药品生产企业进行实习。
1、遵守中华人民共和国宪法和法律;高级中等教育学校毕业或具有同等学力者可报名。
2、在高级中等教育阶段非应届毕业年份以弄虚作假手段报名并违规参加普通高等学校招生全国统一考试(以下简称全国统考)的应届毕业生学校不录取。
3、体检要求：按教育部颁发的《普通高等学校招生体检工作指导意见》执行。各专业均不招收色盲、色弱的考生。
培养目标药学专业培养德、智、体、美全面发展，具有良好职业道德和人文素养，掌握药品安全合理使用、安全生产、质量检查、法律法规等知识，熟悉药品销售和质量管理知识，从事药品调剂、静脉药物配置、用药指导、制剂生产、质量检验、药品销售、物流管理工作的高素质实用型药学专门人才。
就业方向药学专业主要面向各级医院、制药企业等单位，在医院药剂科、企业生产部、质量部等岗位，从事药品调剂、静脉药物配置、药库管理、用药指导、药品生产、质量检查、质量管理等工作。药学系历届毕业生一次性就业率均达到了95%以上。每年也有为数不少的学生顺利通过专升本考试乃至后期研究生考试，实现自己进一步深造的愿望，为我校赢得了较高的社会认可度。
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