康复理疗系
基于社会的需求及学院自身的发展，云南新兴职业学院于2006年创建了康复理疗系，至今已开设社区康复、戒毒康复及老年服务与管理三个专业，并面向社区康复、戒毒康复及老年服务与管理一线岗位。
康复理疗系现有教师61人。其中，教授6人，副教授20人，双师型人才32人；具有高、中级技术职称教师占专任教师的43%，具有硕士学位的15人，占专任教师的24%。专职教师是学校师资队伍的骨干，主要承担本专业的基础课、专业基础课及实践、实训课的教学任务。现已建成传统疗法和作业治疗20余个大专生实验室和护理实操室。
制药技术系
制药技术系现有高职大专药物制剂技术、中药制药技术、生物制药技术、中草药栽培、药品质量检测技术、药品经营与管理七个专业，五年制大专有中药制药技术、药物制剂技术、药品经营与管理三个专业，三年制中专有中药制药技术、药物制剂技术两个专业。我系具有优良的师资、完善的实验实训设施、购销实训软件和齐全的教学设备，现有专任教师36名，承担本专业主要基础课、专业基础课、专业课和实践课的教学任务。
设有制药技术实训中心，下分无机化学实验室、分析化学实验室、有机化学实验室、中药化学实验室、药物化学实验室、生物生化实验室、制药综合实验室、显微鉴定实验室、中药药理实验室、中药材标本实训室、药品购销实训室等11个实训室。
护理系
护理系开设有护理（高级护理方向）、护理（临床护理方向）、护理（中医护理方向）、护理（麻醉护理方向）、护理（涉外护理方向）五个统招专业。
护现有2个护理示范教室，4个模拟病房实训室，28个护理单元，1个产科实验室及ICU模拟病房，内设安尼人，拥有教学、办公用房约8000平方米，系内设有基础护理教研室、临床护理教研室、心理学护理教研室和校内护理实训基地四个教学单位。护理实训基地设有护士站，6个模拟式病房(48张床位）、示教室、消毒室、抢救室、形体训练室等。
2.云南新兴职业学院推荐专业排名1、 社区康复 推荐指数: 4.3(17人推荐)
2、 药品经营与管理 推荐指数: 4.4(13人推荐)
3、 中药制药技术 推荐指数: 4.8(10人推荐)
4、 药物制剂技术 推荐指数: 3.3(10人推荐)
5、 生物制药技术 推荐指数: 3.0(10人推荐)
6、 医药营销 推荐指数: 4.3(9人推荐)
7、 中草药栽培技术 推荐指数: 3.8(9人推荐)
8、 老年服务与管理 推荐指数: 3.6(9人推荐)
9、 生化制药技术 推荐指数: 3.3(9人推荐)
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