延边大学始建于1949年，是中国共产党最早在少数民族地区建立的高校之一。曾隶属于国务院高教部，1957年划归吉林省所属。
1958年8月，延边大学分立为延边大学、延边医学院、延边农学院、延边工学院。
1996年经原国家教委批准，原延边大学、延边医学院、延边农学院、延边师范高等专科学校、吉林艺术学院延边分院等延边五所高等院校合并为新的延边大学。
同年10月中外合作办学机构—延边科技大学(筹)并入。
经吉林省人民政府批准，延边大学珲春校区于2020年正式招生。
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