截至2020年底，通过生物工程专业认证高校名单共计20所，通过认证时间比较早的大学有北京化工大学、华东理工大学、南京工业大学、浙江工业大学、昆明理工大学等，说明这些学校生物工程专业是比较强势的，以下是具体名单一览表，供大家参考：
| 序号 | 学校名称 | 专业名称 | 有效期开始时间 | 有效期截止时间 | 备注 |
| 1 | 北京化工大学 | 生物工程 | 2017 年 1 月 | 2025 年12 月（有条件） | |
| 2 | 华东理工大学 | 生物工程 | 2017 年 1 月 | 2025 年12 月（有条件） | |
| 3 | 南京工业大学 | 生物工程 | 2018 年 1 月 | 2023 年 12 月 | |
| 4 | 浙江工业大学 | 生物工程 | 2018 年 1 月 | 2023 年 12 月 | |
| 5 | 昆明理工大学 | 生物工程 | 2018 年 1 月 | 2023 年 12 月 | |
| 6 | 大连工业大学 | 生物工程 | 2019 年 1 月 | 2024 年12 月（有条件） | |
| 7 | 江南大学 | 生物工程 | 2019 年 1 月 | 2024 年12 月（有条件） | |
| 8 | 常熟理工学院 | 生物工程 | 2019 年 1 月 | 2024 年12 月（有条件） | |
| 9 | 浙江科技学院 | 生物工程 | 2019 年 1 月 | 2024 年12 月（有条件） | |
| 10 | 陕西科技大学 | 生物工程 | 2019 年 1 月 | 2024 年12 月（有条件） | |
| 11 | 天津大学 | 生物工程 | 2020 年 1 月 | 2025 年12 月（有条件） | |
| 12 | 福建师范大学 | 生物工程 | 2020 年 1 月 | 2025 年12 月（有条件） | |
| 13 | 四川大学 | 生物工程 | 2020 年 1 月 | 2025 年12 月（有条件） | |
| 14 | 天津科技大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 15 | 大连理工大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 16 | 沈阳化工大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 17 | 淮阴工学院 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 18 | 福建农林大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 19 | 齐鲁工业大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） | |
| 20 | 郑州轻工业大学 | 生物工程 | 2021 年 1 月 | 2026 年12 月（有条件） |
说明：
“专业名称”为专业的当前名称，部分专业在认证有效期内曾用其他名称，详请查询中国工程教育专业认证协会网站（http://www.ceeaa.org.cn/）；
部分专业已参加多轮次认证，“有效期开始时间”为首次通过认证的有效期开始时间，“有效期截止时间”为最近一轮通过认证的有效期截止时间；总的有效期起止时间不具比较意义；
部分专业的“有效期截止时间”包含“（有条件）”的，表示需要根据其最近一轮认证有效期内中期审核结论决定是否延长至有效期截止时间；
部分专业在部分年份不在认证有效期，相关信息在“备注”栏说明。
生物工程专业简介：
生物工程是中国普通高等学校本科专业。
课程体系：《发酵工程》、《生化工程》、《细胞工程》、《基因工程》、《普通微生物学》、《动物学基础》、《生物信息学》、《生物技术制药》、《生物分离工程》、《蛋白质工程》 部分高校按以下专业方向培养：食用菌、发酵工程、生物农药、生物质能源、微生物应用、农业生物技术、食品发酵与生物制剂。
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