在2021年全国大学排行榜中，山东农业大学排名第一百零五位。重点学科为园艺学，作物学，农业资源与环境。
山东农业大学全国排名第一百零五位
学校设有农学院、植物保护学院、资源与环境学院、林学院、园艺科学与工程学院、动物科技学院（动物医学院）、机械与电子工程学院、经济管理学院（商学院）、食品科学与工程学院、生命科学学院、外国语学院、公共管理学院、水利土木工程学院、信息科学与工程学院、化学与材料科学学院、国际交流学院、体育学院、艺术学院、马克思主义学院、继续教育学院和农民学院等21个学院。
山东农业大学优势专业
在山东农业大学所有专业中，园艺学、作物学专业排名并列第六；农业资源与环境专业排名第九。
| 序列 | 专业名称 | 专业排名 |
| 1 | 园艺学 | 6 |
| 2 | 作物学 | 6 |
| 3 | 农业资源与环境 | 9 |
| 4 | 林学 | 10 |
| 5 | 植物保护 | 10 |
| 6 | 兽医学 | 10 |
| 7 | 农业工程 | 12 |
| 8 | 农林经济管理 | 17 |
| 9 | 风景园林学 | 23 |
| 10 | 生态学 | 30 |
| 11 | 生物学 | 34 |
| 12 | 外国语言文学 | 92 |
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