微机在微生物实验室中的应用主要有二个方面：①微生物的分类和鉴定;②微生物实验室管理，本章只涉及第一个方面。
微生物实验室的主要任务是进行微生物的分离、培养和鉴定。随着生物化学、免疫学和分子生物学的发展，临床微生物实验室也不断引入一些新的技术和方法，列如单克隆抗体、酶免疫标记、荧光免疫、和酸探针和PCR等新技术也都在微生物实验室得到了应用，但就目前国内大多数医院和卫生防疫部门的微生物实验室而言，设备和技术手段仍比较落后，工作范围仍以临床细菌学检验为主。
临床细菌学工作中，新的病原菌不断被发现，新的生物化学试验不断被采用，其工作量大大增加。特别是近年来常遇到生化反应或血清学试验不典型的菌株，仅靠传统的典型生化反应模式往往不宜作出正确的鉴定，需要寻找新的手段。
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