北京中医药大学目前设有中医学、中药学、中药制药、药学、针灸推拿学、康复治疗学、公共事业管理（卫生事业）、药事管理、信息管理与信息系统、护理学、英语（医学、中医药国际传播）、法学（医药卫生）12个本科招生专业。坚持立德树人根本任务，注重从丰厚的中华文化和中医药文化土壤中汲取营养，将“以文化人”理念贯穿于育人工作的始终，培养德智体美劳全面发展的社会主义建设者和接班人。现有全日制在校生12602人，其中研究生4504人，本科生7536人，留学生562人。另有继续教育学生1864人，远程教育学生17859人。
北京中医药大学是全国高等中医药院校中首批建立博士学位点和博士后科研流动站的单位之一，设有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站。拥有3个一级学科博士学位授权，囊括42个二级学科博士学位授予点，7个一级学科硕士学位授权，囊括45个硕士学位授予点。学校现有一级学科国家重点学科2个，涵盖二级学科国家重点学科15个，国家中医药管理局重点学科48个，一级学科北京市重点学科2个，二级学科北京市重点学科8个。
学校现有3个国家级教学团队，1个国家级实验教学示范中心，3个国家级大学生校外实践教育基地。学校获得国家级教学成果奖一等奖1项（参与完成）、二等奖2项，北京市教学成果奖一等奖8项、二等奖10项。
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