在美国高等院校中，霍普金斯大学的医学院长期以来享有崇高的声誉。它的医学院和公共卫生学院不仅建立时间最悠久，而且在众多相关学科领域一直保持全美、甚至全世界的领先地位。在美国历年进行的全美医学院评比中，霍普金斯大学的医学院始终名列前三名。霍普金斯大学的医学院里，云集了许多包括诺贝尔奖获得者在内的一流医学专家。然而被称为医学预科“制造厂”的名誉可以说是误导人的，因为霍普金斯在工程、社会与人文学科、国际学等领域亦有强大实力。霍普金斯大学的工学院也极为出色。自1913年建立起霍普金斯大学怀廷（Whiting）工程学院起，工程教学和研究一直在该校受到极大重视。现代CPR技术是由该校工学院的教授创造出来的。此外，给河水加氯消毒的早期研究工作也是最先在霍普金斯大学的工学院进行的。霍普金斯大学在社会科学和人文学科方面也具有很高的知名度。以人文学科为例，霍普金斯大学的写作研讨班（Writing Seminars）驰誉全美。在这个富有特色的“写作研讨班”里，学生们在教师的悉心指导下，认真研读英美名作家的经典之作，寻求和探索他们的写作风格和写作技巧，然后把名作家的写作方法应用于自己的写作练习之中，从中感受艺术大师的写作经验。在社会科学方面，约翰霍布金斯大学政治系的国际研究课程不仅在该校是最受欢迎、选修学生最多的课程，而且在全国高校的同类学科中属于佼佼者。尤其值得一提的是霍普金斯大学的尼采高级国际研究学院（SAIS）。该学院成立于 1943 年，1950 年并入约翰·霍普金斯大学，其宗旨是为“有志于在政府、国际组织、商业、银行、新闻、教育和研究机构谋职的人提供研究生层次的培训”。在过去五十多年里，尼采学院为美国政府和国际组织培养了人数相当可观的政府和外交等人才，直接影响着各国的外交决策与外交活动。此外，为了扩大与国外大学的学术交流，霍普金斯大学还与意大利的博洛尼亚大学（建于1088年，欧洲大陆现存最古老的大学）、中国的南京大学合办跨文化研究性质的研究中心，使美国学生有机会与欧洲学生和中国学生一起学习，一起交流，一起研究，培养和造就了解多国政治、经济、历史、文化、法律、外交和社会的专门人才。
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